馬自達 CX9 常見故障主要有以下這些。

內飾方面，座椅可能出現材質褪色、有裂痕或破損的情況。空調系統送出的風可能有霉味或異味。

行駛過程中，方向盤可能有異響，剎車可能有噪聲，車窗可能磨損、損壞或無法正常使用。

發動機方面，在 2008 至 2012 款車型中，有報告稱行駛約 10 萬英里左右時可能出現故障。2013 款 CX-9 可能存在動力剎車助力器失效的問題，增加制動距離影響安全。部分車型的變速器可能有硬換擋和滑動的問題。

車輛前端可能有異響，可能是懸掛部件磨損。水泵可能完全失效，導致發動機過熱損壞。車身控制模塊可能因天窗排水堵塞而受損。

2018 年車型曾因線束連接器端故障，可能影響汽車電氣通訊而召回。

不過，馬自達 CX9 整體小毛病并不多。