多次占用應急車道扣分是會加重的。

根據相關規定，駕駛機動車在高速公路上違法占用應急車道行駛一次，扣 6 分，罰款 20 元至 200 元。如果多次占用應急車道，會面臨更嚴厲的處罰。

2019 年曾有提案，建議對違法占用應急車道的行為處以罰款 3000 元、扣 12 分的處罰，對累計 3 次違法占用應急車道的行為，除罰款扣分外，還應拘留 15 天。

同時，深圳也有相關規定，駕駛機動車在高速公路、城市快速干道或隧道內形式，有非緊急情況占用應急車道、路肩行為的，處 3000 元罰款，一年內有該行為 3 次以上的，除罰款外，從第三次起每次并處暫扣機動車駕駛證三個月。

而且，對于違法占用應急車道行為的處罰，還應考慮是否引發交通事故，未引發交通事故扣 12 分，引發交通事故應追究刑事責任并終身禁駕。

此外，在公安部起草的《道路交通安全違法行為記分管理辦法（征求意見稿）》中，在高速公路或者城市快速專用道上，違法停車或違法占用應急車道、路肩行駛的，原來 6 分，現在 9 分。

總之，應急車道是生命通道，非緊急情況切勿占用，多次占用將面臨更重處罰。