牧馬人中最保值的顏色是黑色和白色，在同樣配置和車況的前提下，黑白兩色通常會比其他顏色多賣 1000 元左右。

其次是軍綠色和灰色。相比顏色，車輛是否為素車對保值率影響更大。原廠素車往往是二手買家的首選，重度改裝的牧馬人保值率不如原廠車型。

傳統的常見中性色彩如黑色、白色、銀色在二手車市場受歡迎程度高，保值。

特殊的、珍稀的顏色如黃色，由于稀缺性在二手市場上也具有一定吸引力。吉普牧馬人車型有多種艷麗顏色，像夏威夷晚霞黃等，但這類顏色可能價格較高，為保值需精心呵護。

目前牧馬人三年保值率為 72%，七年保值率為 47%，表現不錯。