車輛有違章未處理不能進行年審流程。

根據相關規定，申請車輛年審前，機動車所有人應當將涉及該車的道路交通安全違法行為和交通事故處理完畢。

比如《機動車登記規定》第四十九條就明確，機動車所有人在申請檢驗合格標志前，要處理好違章。

還有《道路交通安全法》第十三條也指出，登記后上路行駛的機動車應定期進行安全技術檢驗，且不能有違章記錄才能通過。

國家規定，機動車年檢不僅要定期通過尾氣檢測、汽車外觀、車燈、剎車、底盤等檢測合格，還得無違章記錄，才能發放檢驗合格標志。

而且，所有年檢日期按行駛證上登記的日期為準。

另外，除大型載客汽車、校車以外的機動車，因故不能在登記地檢驗的，機動車所有人向登記地車輛管理所申請委托核發檢驗合格標志前，也得把涉及機動車的道路交通安全違法行為和交通事故處理完。

總之，車主在年檢前一定要提前處理好所有的違章記錄，這樣才不會影響年檢的進度。要是有違章未處理，工作人員會提供違章處理告知單，要求處理完再參加年檢。處理違章可能會有時間延遲，所以提前處理能避免不必要的麻煩。