在實習期駕駛證新規定中，導致扣分有特殊處理的違法行為主要有以下幾種。

C 類及以上駕駛證的駕駛人在實習期內被記滿 12 分，將被取消駕駛資格，需要重新參加科目一考試合格后才能恢復。

A、B 類駕駛證的駕駛人，實習期內只要被記 6 分以上但未達到 12 分的，實習期將會延長一年。在此期間，如果再被記 6 分以上，也會被取消駕駛資格。

對于大型客車、牽引車、城市公交車、中型客車、大型貨車駕駛證的駕駛員，在一年實習期內記 6 分以上但未達到 12 分，實習期限將延長一年。而在延長的實習期內再次記 6 分以上但未達到 12 分的情況下，將注銷其實習資格。

另外，代替實際機動車駕駛員接受交通違法行為處罰和記分牟取經濟利益的，記 12 分。

駕駛擅自改變已登記的結構、構造或者特征的載貨汽車上道路行駛的，記 1 分。

實習期內記滿 12 分不會注銷最高準駕車型駕駛資格，而是注銷實習的準駕車型駕駛資格。

還有，違反規定使用燈光和雙閃扣 1 分，不系安全帶或開車打電話扣 2 分，未按照禁止標線指示行駛扣 3 分，未按規定避讓校車扣 6 分，高速公路上停車扣 6 分，高速公路倒車、逆行、穿越中央隔離帶調頭扣 12 分。

總之，實習期駕駛員要嚴格遵守交通規則，確保自身和他人的交通安全。