停在臨時停車位上被拍違章停車，有可能是合法的，也有可能不合法，需視具體情況而定。如果未在規定時間內停車，或是沒有將車輛停放在規定泊位內，即便處于臨時停車位區域，被拍違章停車也是合法的。因為交通法規明確規定，機動車應當在規定地點、規定時間停放。而要是按規停車卻被誤拍，那這種情況就不合法了。

部分路段會設置允許機動車停車的時間段警示標牌，要是未在這個規定時間內停泊車輛，就構成了違法。比如有的臨時停車位規定只允許在夜間特定時段停放，若白天停在那里，被拍違章停車就是合理合法的。還有，當路段施劃有停車泊位時，必須將車輛準確停放在停車泊位內，即使在規定時間內，若隨意停放超出泊位，同樣會被認定為違章。

在禁止車輛暫時或長時停放的禁止停車標志區域內，只要停車就屬于交通違法。即使是在有允許臨時停車標志的道路，若駕駛員離開車輛且停留時間過長，也可能被視作違章。一般來說，在商業區域或上下車頻率高的地區，臨時停車時駕駛員不離開的短暫停留才被認可為臨時停車。

若對自己停在臨時停車位卻被拍違章停車存在疑問，首先要仔細確認罰單具體內容，包括違法停車的時間、地點等信息是否準確。要是認為自己停車行為不屬于違法，如臨時停車位標識不清、停車時間未超出規定等，可在規定時間內申請行政復議，準備好停車時的照片、視頻等相關證據，向作出處罰決定的上級機關提出復議申請。

總之，停車是否被認定為違章要依據具體的交通法規和實際停車情況來判斷。車主們停車時務必留意周邊的交通標志標線，按規、按位、按線、按向停車，避免不必要的違章處罰。