林肯航海家的保養費用相對較高。

保養周期通常為每 10000 公里或每年一次。常規保養項目包括機油更換、機油濾清器更換、空氣濾清器檢查與更換、剎車油檢查與更換等。

以 2021 款航海家 2.0T 四驅尊雅版為例，小保養更換機油和濾清器費用約 1225 元，6 萬公里定期保養總費用約 4878 元，10 萬公里定期保養總費用 11141 元。2.7T 車型小保養費用也約 1225 元，6 萬公里定期保養總費用約 5388 元，10 萬公里定期保養總費用 12161 元。

保養配件方面，原廠全合成機油 SN 級 5W-30 參考價格 96 元/桶/1L，2.0T 發動機需 5.2L 機油，2.7T 發動機需 5.7L 機油，參考工時費 500 元。原廠機油濾清器 149 元/個，濾芯工時費含在更換機油工時內，建議每 10000km 更換。原廠空氣濾芯 220 元/個，參考工時費 130 元，建議每 30000km 更換。原廠空調濾芯 200 元/個，參考工時費 240 元，建議每 20000km 更換。原廠燃油濾清器 546 元/套，參考工時費 150 元，建議每 40000km 更換。原廠火花塞 255 元/個，2.0T 用量 4 個，2.7T 用量 6 個，參考工時費 200 元，建議每 40000km 更換。原廠剎車油 108 元/桶/500ml，用量約 2L，參考工時費 450 元，建議每 40000km 更換。原廠自動變速箱油 95 元/桶/1L，濾芯 685 元/個，共 1445 元，用量約 8L，參考工時費 750 元，建議每 80000km 更換。原廠剎車盤前 1890 元/對，后 1760 元/對，參考工時費 650 元，建議每 50000km 更換。原廠剎車片前 1430 元/對，后 1150 元/對，參考工時費 460 元，建議每 40000km 更換。原廠防凍液 151 元/桶/4L，用量 8L，參考工時費 280 元，建議每 2 年更換。原廠輪胎參考價格 1157 元/條（245/60 R18）、1489 元/條（245/50 R20）、2280 元/條（265/40 R21），參考工時費 100 元，建議每 60000km 更換。原廠正時鏈條一般免維護，但出現問題時參考價格 895 元/條，參考工時費 4500 元。

林肯品牌通常提供一定期限的免費保養服務，如 5 年 10 次免費基礎保養，包含機油、機油濾清器和工時費。

總體來說，航海家保養費用較高，車主在購買前應充分考慮長期保養成本