相比有卡 ETC，無卡 ETC 弊端不少。

車主負擔會加重，因為無卡 ETC 無法享受優惠，每次通行費用高，增加經濟負擔和道路擁堵風險。

車輛管理難度大，僅靠車牌識別，車牌易偽造，車主可能逃避交通違法處罰和費用繳納，給交通管理和車主生活帶來不便。

隱私泄漏風險高，不法分子能輕易獲取車主隱私，威脅車主財產和生命。

缺乏交通信息互動，不能像有卡 ETC 那樣提供路況、天氣、違章提示等信息，車主難以掌握車輛行駛情況。

司機認證困難，所有人能用同一車牌繳費，無法預防車輛盜竊，還影響市場競爭。

無法與其他系統互聯，相關部門不能及時了解交通擁堵情況，降低管理效率，也不能與便民服務互聯，影響城市運行效率和服務質量。

后期管理成本高，車輛管理和車牌修改在后期操作，設備不能重復使用，故障或廢棄需重新購買安裝。

還缺乏發票開具功能，對貨運公司不方便，增加企業經濟負擔和稅收難題。