在深圳進行車輛違章查詢申訴，需先準備身份證、行駛證、駕照等材料，前往車輛牌照歸屬地的車管所車輛科提起行政復議，目前不支持網上申訴 。具體來說，若對警告、罰款等裁決不服，可在接到通知后十五日內申訴，相關機關會在五日內作出裁決；對吊扣駕駛證裁決不服，應在接到裁決書后五日內申請復議。申訴方式有口頭和書面兩種，后續根據處理結果再做相應打算。

在申訴方式的選擇上，車主擁有一定的自主性。如果選擇口頭申請復議，車主需要前往上一級機關的法制部門，在那里進行詳細的口頭陳述，同時要提供行政處罰決定書。這要求車主在陳述時條理清晰，準確地闡述自己認為違章判定不合理的原因。而書面申請復議，則需要車主認真填寫行政復議申請書，在其中詳細載明申請復議的事實、理由和要求。書面申請相對更加正式、嚴謹，車主需要將申訴的關鍵要點一一清晰羅列，確保交管部門能夠全面了解情況。

當提交申訴之后，交管部門便會開啟認真且細致的審核流程。他們會重新核對違章內容和處罰的各個環節，不放過任何一個細節。在七個工作日內，車主就會收到交管部門給予的答復以及相應措施。這個過程體現了交管部門對申訴的重視，以公正、客觀的態度去重新審視每一個申訴案件。

如果車主對復議結果仍然存在異議，認為處理結果不夠公正合理，那么還有進一步的救濟途徑。可以在接到通知后的五日內向當地人民法院提起訴訟，通過法律的途徑來維護自己的合法權益。

此外，在整個申訴過程中，還有一些重要的注意事項。對交通違法行為處罰有異議的，必須通過交警隊或者車管所業務大廳處理，無法通過網上進行申訴。在申訴前建議先繳清罰款，并了解違章詳情，比如調看監控錄像等，這能夠讓車主更加清楚地掌握違章情況，為申訴提供有力的支撐，有助于申訴成功。同時，在進行交通違章申訴前，車主應先仔細閱讀相關條例和規定，確保材料齊全、申訴理由充分，這樣才能提高申訴成功的幾率。

總之，深圳車輛違章查詢申訴有著明確的流程和規定，車主只要按照要求準備材料、選擇合適的申訴方式，積極配合交管部門的審核，在遇到不滿意的結果時合理運用法律手段，就能更好地維護自身的權益，讓違章申訴的過程更加順暢、公正。