1、甲醇對油泵有腐蝕，而且油耗也高，低溫條件下啟動也很差。油改氣的話則要加裝整套天然氣系統，費用高。另外，氣罐一般在后備箱，如果出現追尾，危險性也較高，而且到冬天的時候燃氣告急，加氣站經常排很長的隊。

2、損壞傳統燃油泵。因為傳統燃油泵屬于直流碳刷導電，甲醇導電性與汽油不同，需要更換鼠籠式變頻燃油泵。鼠籠式式結構沒有碳刷導電和棵露導線，在液體內導電氧化而腐蝕導線。

3、對發動機機械系統的影響：冷車狀態下，甲醇噴入發動機后如不能快速著火燃燒，未燃甲醇將沿氣缸壁下流，一方面破壞了氣缸壁表面的潤滑油膜，造成啟動過程中氣缸與環間的潤滑不良并造成密閉性下降，從而加大了氣缸的磨損。

4、因為甲醇可以增加汽油的含氧量，使發動機燃燒充分，還可以充分減少一氧化碳和甲烷的排放，有效清除發動機和機油系統的積碳。維護發動機設備，延長使用壽命。

5、但是與乙醇不同的是甲醇本身有毒性，對有色金屬有腐蝕作用，對橡膠件有溶脹作用，所以必須對發動機以及車上的燃料輸配系統進行針對性設計。這種專門設計的用于燃燒甲醇燃料的汽車就稱為甲醇汽車。

6、甲醇可以增加汽油中的含氧量，能夠使汽油燃燒更充分，有效的減傷汽車尾氣中有害氣體的排放。再就是甲醇汽油的辛烷值要比國標汽油高3到5個單位，動力性更強。