北京購車搖號新方案保障公平公正主要通過以下方式。

一是嚴厲打擊違法現象，相關部門加大執法檢查監督力度，整治低下交易、倒號等亂象。

二是不斷完善政策并使之法制化，解決執行中產生的矛盾，確保長期公平有效運行。

三是確保監督全面透明，公證員對基數確定、搖號程序、結果產生與發布等全流程監督，破除謠言，維護政策權威性。

四是增加政策執行透明度，擴大公眾在監督人員任選上的知情權、參與權、選擇權和監督權，多渠道讓群眾參與監督，認真對待公眾監督反饋，避免形式化。

五是兼顧增量公平和存量公平。增量公平方面，采取“無車家庭”政策，提升中簽概率，按積分自上而下分配新能源車指標。存量公平方面，推動個人名下第二輛及以上在本市登記的小客車有序退出，讓一人多個指標的“背戶販子”退出。

六是針對企業用車，關注“高精尖產業”，如制造業、信息傳輸等企業以完成固定資產投資額為條件申請指標。

七是調整家庭新能源指標占比，設置三年過渡期，如 2021 年新能源小客車配置指標數量的 60%優先向“無車家庭”配置。

通過這些措施，北京購車搖號新方案在最大程度上保障了公平公正，讓更多有需求的家庭和個人能夠公平獲得購車資格。