巴南區購車補貼申請不通過的原因主要有以下幾種。

一是發票地不符，比如您購車的發票開具地點不在巴南區，就可能導致申請不通過。

二是發票時間不在補貼申請時間范圍內，比如規定的申請時間是某個時間段，而您的發票時間不在這個范圍內。

三是登記上牌時間不符合規定，可能存在上牌時間過早或過晚的情況。

四是車輛類型與政策詳情不符，比如政策規定只補貼某種特定類型的車輛，而您購買的車輛不屬于該類型。

如果您遇到補貼申請不通過的情況，別著急。按照系統指示，通過拍照上傳購車信息進行人工復核就行。只要您通過了復核，補貼就會自動轉到您的支付寶賬戶。市商務局和市財政局會對您的申訴材料進行嚴謹審議。符合條件就給您辦理補助支付，不符合會明確告知理由，申訴結果也會通過審理頁面及時反饋給您，整個流程是公正透明的。

總之，您在申請購車補貼時，一定要確保每一步的信息都準確無誤，這樣就能順利拿到補貼啦。