寶馬 X6 的安全配置十分豐富。

標配了正面臀部與胸部氣囊，還有側面頭部防護氣簾，充氣后能覆蓋 A 柱與車頂，全方位保護前后乘員。

前座椅配備安全帶限力器和安全帶張緊器，前座椅還有碰撞激活式頭枕，能減少車輛碰撞時頭部后甩的距離，降低乘員頸椎受傷的風險。

同時，擁有胎壓顯示和車身穩定控制。主/被動安全配置齊全，包括全液晶儀表盤、方向盤加熱、發動機啟停、前駐車雷達、LED 日間行車燈、牽引力控制、手機無線充電、疲勞提醒、車道保持、自動泊車、陡坡緩降、上坡輔助、自動駐車、缺氣保用輪胎、后駐車雷達、側安全氣簾、制動力分配、制動輔助、防抱死制動、HUD 抬頭顯示、兒童座椅接口等。

其中全液晶儀表盤個性化選擇多、信息豐富效果生動，還支持自定義功能。發動機啟停能節省 10%到 15%的燃油消耗。牽引力控制能讓汽車在各種行駛狀況下獲得最佳牽引力。

主動安全配置方面，有前方碰撞警告、自動緊急制動、盲點監控、車道偏離輔助等。自適應巡航控制系統讓行駛更安全智能，自動停車系統也讓人放心。車道偏離預警、車道保持輔助、主動剎車以及疲勞駕駛提示在尊享型上配備，不過并線輔助需要選裝。

前碰撞警告和自動緊急制動系統是標準裝備。雙前座安全氣囊、前后排頭部安全氣囊和駕駛員與前排乘客側面安全氣囊不會因低配而減配。自動防炫目后視鏡、主動保護系統和碰撞防御輔助等主動保護裝置也是全系標配。