林肯航海家混動版的保養成本不算高。

從保養情況看，其基礎保養間隔周期是 10000 公里，每次保養要進行機油機濾等配件更換，需近 1000 元費用。

后續隨行駛里程增加，每隔 20000 公里換一次空調濾芯，約 200 元；每隔 30000 公里換空氣濾芯，約 200 元；行駛 40000 公里時換汽油濾芯、火花塞和制動液等配件，費用較高，約 3000 元。

以家用車三年行駛 60000 公里作為保養周期，林肯航海家混動版車型三年總共保養成本約 10000 元，平均每年約 3330 元。

相比 2.0T 燃油版車型，因多了電機等方面檢查，后期費用略貴。但和 2.7T 車型比，保養周期及項目基本一樣，材料費用有差異，比如火花塞數量增多，發動機養護項目增多，2.7T 車型每年保養成本基本在 4000 元以上。

用上混動系統，平均每月油費不到 1000 元。以一年行駛 20000 公里計算，油費方面，以該車 8.4L/100km 的工信部綜合油耗，以及目前北京 92 號汽油的 5.75 元價格計算，一年需花費油費大致為 9660 元。

另外，林肯航海家混動車型發動機型號和福特銳界 L 2.0T 混動七座版四驅車型相同，兩款車都是中型 SUV，可參考福特銳界 L 油耗。而且車身尺寸差別不大。

總體來說，結合該車出色的整車產品競爭力，以及比較容易被接受的價格，其后期養車成本是比較親民的。