水陸兩用車的動力來源較為多樣。常見的有電動、燃油以及混合動力等。

比如三輪房車，其在陸地上行駛時，由踏板提供動力，上坡時可選擇使用兩個電動機，電量來自兩個電池組和一個太陽能電池板。

而一些較為先進的水陸兩用車，如英國推出的“超級水陸兩用汽車”，發動機采用全封閉裝置，直到汽車完全報廢為止無需更換，既安全又不會污染空氣和水源。

還有一些車型，像加拿大瓦爾特水陸兩棲車，采用美國科勒（Kohler）4沖程OHV V-Twin空冷型電子燃油噴射發動機驅動。

另外，水陸兩用車輪及動力系統中，其陸地行駛功能通過車輪外圈與地面的摩擦力實現，水下推進效果通過可調旋轉角度的輻條以及車輪主體轉動來達成，動力源為同一動力輸入系統。

在水陸兩用客車中，電力驅動系統包括供電部分和驅動部分。供電部分采用蓄電池組，驅動部分包括依次連接的電動機、變速箱、分動箱，分動箱的不同輸出軸通過電磁離合器分別連接前輪驅動橋、后輪驅動橋和水上推進裝置。車輛控制系統根據行駛模式控制電磁離合器的閉合狀態，實現不同行駛模式的切換。