手動變速器故障自行診斷可以從以下幾個方面入手。

跳檔：汽車在加速、減速、爬坡或劇烈振動時，變速桿自動跳回空擋。原因可能是自鎖裝置的鋼球未進入凹槽、齒輪未全齒長嚙合、自鎖裝置磨損、齒輪磨損成錐形、一、二軸軸承松曠、二軸齒輪間隙大、各軸間隙大等。診斷時，先確定跳擋擋位，熱車后逐擋路試，將變速桿掛入跳擋擋位，熄火后拆變速器蓋觀察嚙合情況。

亂檔：在離合器正常時，變速器同時掛兩擋或掛錯擋。原因可能是互鎖裝置失效、變速桿下端或撥叉軸磨損、定位銷折斷等。診斷時，掛擋后看變速桿擺轉角度，超出正常范圍多為定位銷等問題；擺轉角度正常但掛不上或摘不下擋，可能是下端脫出；同時掛兩擋則是互鎖裝置問題。

掛擋困難：離合器良好但掛擋不順利，有撞擊聲。原因可能是同步器故障、撥叉軸問題、一軸損傷、齒輪油問題等。診斷時，檢查同步器、一軸、撥叉軸。

變速器異響：工作時有不正常響聲。原因可能是齒輪磨損、軸承磨損、其他部件問題等。診斷時，缺油或油質不好會有金屬干摩擦聲；行駛時某擋響可能是該擋齒輪問題；空擋響多為一軸軸承，換任何擋都響多為二軸軸承；突然撞擊聲多為輪齒斷裂；換擋時響可能是離合器等問題。

變速器漏油：變速器周圍有潤滑油，油量減少。原因可能是潤滑油選用不當、側蓋密封問題、放油塞等螺栓松動、殼體破裂、里程表部件問題等。診斷時，相應更換或調整部件。

總之，自行診斷手動變速器故障需要仔細觀察和分析，若無法確定或解決，應及時尋求專業維修人員的幫助。