在東莞，交通違章扣分的處理方式如下：

處罰權限方面，對當事人處以五十元（含）以下罰款或者警告的，適用簡易程序，由交通民警當場作出處罰決定；五十元以上罰款、吊扣和吊銷機動車駕駛證的，適用一般程序，由縣以上交警部門作出處罰。

交通民警發現交通違章應糾正并責令改正或限期改正，處罰時會告知當事人交通違章行為的事實、處罰理由和依據，當事人有權陳述和申辯，對處罰不服可依法申請行政復議或提起行政訴訟。

具體操作步驟：當事人對交通違章行為無異議的，開具《公安交通管理行政強制措施憑證》和《公安交通管理行政處罰決定書》，當場交付當事人。當事人持《處罰決定書》到指定銀行繳納罰款后，攜帶相關證件到執行機關處理違章窗口取回證件或辦理有關手續。

適用一般程序且違章者有異議的，由民警開具《處罰通知書》，當事人持此通知書和憑證到執行機關接受調查。

對于公民吊銷駕駛證和二千元以上罰款，法人或其他組織一萬元以上罰款，當事人要求聽證的，公安機關按規定執行。

機動車駕駛員有不繳納罰款、不到公安交通管理部門接受處理等情形，超過規定時間的，公安交通管理部門可撤銷其機動車駕駛證、號牌和行駛證。被撤銷機動車駕駛證處罰的，撤銷決定生效一年內不準重新領取。

網上處理：東莞違章網上處理網址，系統處理范圍包括廣東省駕駛證、機動車違法地點在東莞的交通違法、東莞車輛在廣東省外的交通違法、罰款額度在 200 元以下的簡易程序交通違法。

網點處理：所需材料包括《道路交通安全違法行為處理通知書》或《公安交通管理行政強制措施憑證》、車輛合法來歷證明原件及復印件、當事人駕駛證原件及復印件、機動車交通事故責任強制險保險單原件及復印件等。辦理流程為當事人按規定消除違法狀態，帶齊資料到西平交通管理服務中心取號排隊等候辦理，接受調查取證，作出處罰決定，領取返還物品，憑處罰決定書到指定銀行繳納罰款。辦理地點為西平交通管理服務中心，辦公時間為星期一至星期五 9：00 - 17：00。

電子監控處理：電子監控處理網址注冊登陸后即可辦理。處理電子監控記錄前要綁定本人機動車及駕駛證，只能處理 200 元以下罰款的記錄，處理后駕駛證累記記分達 12 分的不允許處理，繳款罰款在線支付成功才算處理成功，且只能為自己名下機動車處理。

繳納罰款：可通過網上自助服務系統、各交警大隊服務大廳的機器自助繳費、指定網站或代理銀行柜面繳納。處理記分的交通違法行為，車主需到大廳內根據廣播叫號通知，到指定業務柜臺受理。