國六藍牌清障車與國五在動力系統上存在一定差異。國六標準限值比國五加嚴許多，排放控制更嚴格，這使得國六車型運用了諸多先進排放控制技術。發動機部分硬件和軟件有改動，如調整燃燒室結構、增加噴油壓力等；排氣管也更長更復雜，增加了不少傳感器及管線。這些改變不僅讓動力輸出更平穩、加速更順暢，還提升了燃油經濟性 。

在排放控制方面，國六標準限值相比國五加嚴了40%至50%左右，且采用燃料中性原則，無論何種燃料排放限值都一樣，而國五時柴油機和汽油機排放標準不同。國六在排放標準上，氮氧化物減少77%，顆粒物減少67%，還引入顆粒數量限值要求。如此嚴格的標準下，國六藍牌清障車的發動機為了達標，使用了性能更好的三元催化器，并且安裝了GPF顆粒物捕捉裝置，這都是國五車型所沒有的。

從硬件變動來看，國六發動機調整了燃燒室結構，讓燃燒更加充分；增加噴油壓力，使燃油霧化更好，提高燃燒效率。同時，使用了更多電子設備，以便更精準地控制發動機的各項參數。這些改變不僅是為了滿足排放要求，也在一定程度上提升了動力性能。

排氣管方面，國六輕卡排氣管更長更復雜，在SCR基礎上增加了DOC+DPF系統。布局的變化使得排氣管增加了顆粒物傳感器、多條溫度傳感器、壓差傳感器等眾多傳感器及管線。不同品牌發動機的國六輕卡后處理系統外觀差異大，配件也可能有較大不同。

總體而言，國六藍牌清障車在動力系統上的升級，是為了順應更嚴格的環保要求。這些升級雖然帶來了一些硬件和系統的改變，但也為車輛帶來了更好的動力輸出、更高的燃油經濟性以及更平穩的駕駛體驗，讓其在滿足環保需求的同時，也提升了自身的綜合性能 。