科目三智能考試系統存在以下不足：

1. 新系統上線初期通過率下降。比如湖州市，上線后通過率為 31.9%，低于之前人工考核。

2. 部分學員對燈光考核不熟悉，容易出錯。如會車時不按規定使用近光燈、不交替使用遠近燈光等。

3. 車輛速度和檔位不匹配易扣分，熄火也會導致扣分。

4. 不能保持直線行駛、騎軋中心實線或車道邊緣實線等操作失誤扣分較多。

5. 不使用或錯誤使用轉向燈也會被扣分。

6. 逆時針繞車一周未完成會導致不合格。

7. 超車時未交替使用遠近光燈提醒被超越車輛會被扣分。

針對這些不足，給出以下解決方案：

1. 考生應加強練習，提高對燈光操作的熟悉度，嚴格按照規定使用燈光。

2. 平時多進行車輛速度和檔位匹配的練習，注意避免熄火。

3. 訓練保持直線行駛的能力，提高對車輛行駛軌跡的控制。

4. 牢記并嚴格遵守轉向燈的使用規則，養成良好的駕駛習慣。

5. 上車前做好準備工作，確保逆時針繞車一周等動作規范完成。

6. 超車時規范操作，交替使用遠近光燈提醒被超越車輛。