4S店有可能免費幫忙進行車輛識別代號查詢，但不能一概而論。4S店與廠家聯系緊密，有專業渠道和設備系統，在新車交接時會保留相關資料，具備查詢優勢。若車輛在該店或其所屬經銷商處購買，查詢可能更為便利。然而，不同品牌、地區的4S店服務政策有別，有些可能免費，有些或許會收取一定費用。建議車主提前致電咨詢，準備好行駛證等證明車輛歸屬的證件。

具體而言，一些注重客戶服務體驗、希望借此提升品牌口碑的4S店，很有可能會為車主免費提供車輛識別代號查詢服務。尤其是當車主車輛是在該4S店購買，并且長期在店內進行保養維護，與4S店建立了良好關系時，免費查詢的可能性就更大。

而部分4S店由于運營成本等諸多因素考量，也許會對這項服務收取一定費用。畢竟查詢車輛識別代號需要投入人力和時間，使用專業設備系統也有相應成本。

除了4S店，車主其實還有不少免費查詢車輛識別代號的方式。線上，交管12123 app、支付寶車寶典小程序、汽車品牌官網等都是不錯的選擇。線下，車輛行駛證、車輛銘牌、機動車產品說明書等，都明確記錄著車輛識別代號的信息。

綜上所述，4S店在車輛識別代號查詢服務收費上存在不確定性。車主在尋求4S店幫助前，不妨先通過其他免費途徑嘗試查詢。若確實需要4S店協助，提前溝通確認是否收費以及收費標準，避免不必要的麻煩，讓查詢過程更加順利。