影響汽車合格證查詢準確性的因素主要有以下幾個方面：

1. 二維碼本身問題：合格證二維碼可能因時間久遠變得陳舊，影響掃描設備識別；或者因物理損傷，如有斷痕、劃痕、過度折疊等，導致無法讀取。

2. 掃描設備問題：未使用專用的掃描槍，或者掃描槍本身存在故障，也會造成無法準確掃描二維碼。

3. 合格證信息錯誤：如出廠日期有誤等，導致信息與車輛實際情況不符，無法通過核查。這種情況是廠家工作人員失誤上傳信息出錯，需要重新更換合格證。

4. 合格證真偽：紙質不好、印刷不清晰、墨色不均勻、號碼字體不符合公安局加密專用字體、水印不清晰完整、微印防偽技術模糊、印章不規范、缺少防偽線、信息不完整或不正確等，都會影響查詢準確性。

針對這些問題，可以采取以下解決辦法：

1. 二維碼問題：如果二維碼陳舊或損壞，聯系購車的 4S 店，讓主機廠重新發送；若有損傷，可嘗試使用其他上牌點的專用掃描槍或復印后再掃描，注意復印深淺度適中。

2. 掃描設備問題：聯系 4S 店更換或修復掃描槍。

3. 信息錯誤：將車管所工作人員的出錯提示用手機拍下取證，然后找經銷商重新更換合格證。

4. 辨別合格證真偽：查看紙和加密筆跡、印刷差異、水印、微印防偽技術、印章、紫光照明驗鈔防偽線、信息完整性等，如有疑問，在車管所進行核實。

同時，在購車時要確保合格證二維碼的完整性和準確性，以便后續保險錄入和上牌流程順利進行。另外，車管所專用二維碼掃描槍有在線式和離線式，可根據需求選擇合適的掃描槍來提高掃描準確性和效率。