手動變速箱維修價格比自動變速箱低很多，差價少則兩三千元，多則上萬元。手動變速箱結構相對簡單，常見維修項目如更換同步器、倒擋齒輪等，維修費用大多不超 2000 元。而自動變速箱構造復雜，像 4 速、6 速等不同類型的維修費用不同，且涉及換擋電磁閥、液力變矩器等故障維修費用更高，少則五六千，多則一兩萬。具體差價受車型、故障情況等因素影響 。

不同車型的變速箱維修價格差異顯著。面包車手動變速箱維修較為便宜，費用大約在三百元，而中檔次轎車維修費用則會上千。自動變速箱方面，面包車的維修成本在數百元到數千元，中檔轎車自動變速箱維修費用可能達上千元。例如日產軒逸的CVT變速箱，維修費用約6000元到8000元，若需要更換零部件，費用可能高達2萬元。這體現出車型對變速箱維修價格的影響較大，高檔車型的自動變速箱維修往往更昂貴。

故障情況也是決定差價的關鍵。手動變速箱若只是常見的漏油、濾油器堵塞等問題，維修費用可能只需幾百元。但如果出現離合器片磨損等問題，更換費用約2000 - 4000元。自動變速箱若遇到換擋電磁閥故障，更換費用約2000 - 4000元；要是液力變矩器故障，更換費用則在5000 - 10000元。不同故障導致的維修價格差異，進一步拉大了手動與自動變速箱維修價格的差距。

此外，維修地點和配件通用程度也會影響價格。4S店的手動變速箱維修費用通常在1000元左右，普通修理廠大約在200元。自動變速箱由于配件相對不那么通用，維修價格普遍更高。綜合來看，手動變速箱與自動變速箱維修價格因多種因素存在較大差異，車主在日常使用中應注重對車輛的保養，降低變速箱故障的發生幾率。