非本人車輛違章在手機上查詢后能否直接處理，需視情況而定。若提前在“交管12123”APP完成非本人車輛的備案綁定，便可以處理備案后的不記分或有記分且適用于簡易程序、單筆罰款不超200元的非現場違法記錄。備案有嚴格規則，如同一用戶最多同時備案3輛非本人機動車等。所以只要按要求完成綁定，手機上就能處理符合條件的違章 。

具體來說，在“交管12123”APP上備案非本人機動車有兩種常見方法。其一是掃描被備案機動車的二維碼；其二是通過車主的短信驗證。選擇對應的未處理違章，在下方點擊處理并交款，同意電子監控違法處理業務規則，進入確認繳款界面，填寫手機收到的驗證碼，點擊確認繳款，就能完成違章處理流程。

不過，備案流程中也有不少注意事項。申請綁定業務的駕駛人需先通過交警支隊車管所人工窗口進行實名注冊。而且可綁定非本人名下機動車不超過3輛（含3輛），歷史累計綁定不得超過5輛車（包括已在“交管12123”手機APP上綁定的），同一機動車只允許最多被3個用戶同時綁定。此外，違章需要是相同的人造成的，不然可能會被當成買賣分來處理，會受到嚴重處罰。

另外，若沒有提前進行備案綁定，自然無法在手機上直接處理非本人車輛違章。這種情況下，車主可以前往當地交通大隊，在現場進行違章處理。

總之，非本人車輛違章在手機上能否直接處理，關鍵在于是否提前完成符合規定的備案綁定。只要遵守相關規則完成綁定，后續處理流程就能在手機上較為便捷地進行，為車主提供了極大的便利。