大眾新桑塔納的常規保養周期為每 5000 公里小保養，每 6 萬公里大保養；保養費用根據車型和保養項目有所不同，手動擋車型 6 萬公里保養費用約 6260 元，自動擋車型約 7267 元。小保養主要更換發動機機油和機油濾芯等，費用約 560 元。大保養項目更多，像更換多種濾芯、火花塞及變速箱油等，手動擋大保養 1200 元，自動擋 2207 元。整體而言，其保養成本相對較低。

具體來說，小保養時除了更換發動機機油和機油濾芯外，還會清理空氣濾清器，讓發動機能夠順暢“呼吸”，保證燃油的充分燃燒，進而提升車輛的動力性能與燃油經濟性。而在每6萬公里的大保養中，更換汽油濾芯可以有效過濾燃油中的雜質，延長發動機的使用壽命；更換火花塞能確保點火系統正常工作，讓發動機運行更為穩定；更換變速箱油對于自動擋車型尤為重要，它能保證變速箱的良好潤滑與散熱，使換擋更加平順。

需要注意的是，保養費用并非固定不變。不同地區的4S店因運營成本等因素，價格會有所波動。而且店內時常會推出一些優惠活動，在活動期間進行保養，能為車主節省不少開支。另外，使用原廠配件相對更加實惠，像機油濾芯、汽油濾芯、空氣濾芯等價格大多在百元以下，4升原廠機油價格也在100元左右。

大眾新桑塔納無論是保養周期的設定，還是保養費用的支出，都充分考慮到了車主的使用成本。合理的保養周期能確保車輛始終處于良好的運行狀態，而相對較低的保養費用，也讓新桑塔納在同級別車型中擁有較強的競爭力，成為不少消費者日常家用的可靠選擇。