自動啟停系統會增加電瓶的損耗。

自動啟停的工況下，發動機已達熱機基礎，各部件條件適宜，對發動機的傷害可忽略，但北方冬季低溫時要少用。

電池壽命能用點火次數評價，單位時間或路程內點火多，壽命下降快。

不過，現在的啟停電瓶性能好，壽命是普通電瓶的三倍，正常使用時和普通電瓶壽命差距不大，但更換更貴。

自動啟停功能頻繁使用確實會損耗電瓶，如車輛頻繁走走停停。

大部分帶啟停功能的車使用的是 AGM 電池，不是普通鉛酸電池，其電循環充電容量是普通電池的 3 倍，使用壽命長，能滿足頻繁充放電需求。如果是普通電池，傷害明顯。

一些車型安裝普通蓄電池時無法打開啟停功能。

配備 AGM 技術的蓄電池，性能優異，有三倍循環壽命。

帶自動啟停的車通常有直噴發動機、耐用型起動機、特殊蓄電池和高品質燃油等配置。

設計之初已考慮車況，所配蓄電池和啟動機能應對問題，但堵車、緩慢入庫、涉水、頻繁上坡起步等情況最好關閉啟停功能，以減少對電瓶的損耗。