阿爾法三代的安全配置較為豐富。

首先有多個氣囊，包括主副駕駛安全氣囊、前排側氣囊、前后排頭部氣簾、膝部氣囊，能在碰撞時提供多方位保護。

還有胎壓報警、前排安全帶未系提醒等功能。

車輛搭載了豐田 TSS 智行安全系統，涵蓋自適應巡航、車道保持、主動剎車、自動泊車、主動轉向輔助、車道偏離警告等功能。

同時，配備了一系列預警系統，如 DOW 開門防撞預警、BSD 盲區監測預警、RCTA 后向車輛穿行預警、RCW 后碰撞預警、FCW 車輛前碰撞預警（帶行人檢測）、LDW 車道偏離預警等，以及駕駛員疲勞預警、駕駛員分心預警。

此外，在被動安全方面，擁有 8 個安全氣囊。

車輛采用了上鋼下鋁的鋼鋁混合車身，底盤大梁為鋁合金材質，具有吸能特性，能在正面、側面、后面發生碰撞時有效實現全方位吸能。

電池方面，使用第 3 代電池系統高標準安全技術，可承受 800℃火燒 30min 電池不爆炸，水下 1m 浸泡 8h 無進水，不僅防碰撞，還能防沙塵和水流，涉水安全有保障。