要自行判斷電動三輪車控制器是否故障，可以從以下方面入手。

首先，觀察車輛運行情況。如果電動三輪車啟動困難，行駛速度異常緩慢或者無法達到正常速度，可能是控制器出了問題。

其次，注意車輛的動力輸出。若感覺動力不足，加速不順暢，也可能是控制器故障導致。

然后，查看車輛的儀表顯示。如果儀表顯示異常，比如電量顯示不準確、速度顯示不穩定等，這也可能暗示控制器存在故障。

還有，留意車輛在行駛中的聲音。若電機發出異常的噪音，如嗡嗡聲、咔咔聲等，有可能是控制器沒能正常控制電機工作。

另外，如果車輛出現突然斷電、無法充電或者充電異常快等情況，也可能是控制器故障的表現。

總之，通過多方面觀察和判斷，能較為準確地確定電動三輪車控制器是否出現故障。