大眾柯斯達的安全配置很豐富。

比如在主動安全方面，它配備了識別行人、騎行者的預碰撞安全保護系統和車道保持輔助系統等，預碰撞安全系統能在碰撞即將發生時顯示警示信號、發出警報聲以及輕微制動，遇到危險還能自動剎車。車道保持系統能識別道路標識和車道邊界，利用主動轉向輔助功能幫助車輛保持在特定車道內行駛。

此外，驅動防滑系統、電子穩定系統、動態電子差速鎖等電子系統能優化車輛動力表現，防抱死制動系統能有效縮短剎車距離。

在被動安全方面，斯柯達車型在中國市場的全系車型至少配備四個安全氣囊，部分車型還提供側前方安全氣囊、頭部安全氣囊等，甚至前排中央安全氣囊也可防止前排乘客頭部相互碰撞受傷。歐洲 ENYAQ iV 系列車型配備九個安全氣囊。而且，斯柯達全系車型標配 ISOFIX 兒童安全座椅固定裝置及頂部系繩錨固點。

同時，斯柯達在車身結構設計上也下足功夫，致力于確保車身既具備高強度扭轉剛性，又能吸收更多碰撞能量，保持乘客艙穩定。

在行人保護方面，斯柯達進行了 200 多項行人保護測試，車身設計在發動機、減震器等零部件之間保留足夠空間，前保險杠加固結構的能量吸收材料也有助于增強對行人的保護，還有預碰撞安全系統等多項配置避免與行人交通事故的發生。