在 4S 店保養手動變速器和在普通汽修店保養主要有以下區別。

4S 店專修一個品牌，對車輛維修知識掌握更專業、熟練，維修人員專業素養高，所用零件更有保證，能享受相應車型的車檢，有專業的技師和配套工具設備，零件可靠性高、庫存充足，更換零件或修理有時更快，還有完善的服務流程和維修后的服務跟蹤系統，有正式的公開投訴渠道和監督體系。

普通汽修店價格便宜，經驗豐富，各種小毛病能應付，保養或維修速度可能比 4S 店快，可自己買機油和配件并觀察保養過程，選擇性多。

但普通汽修店不是某個品牌的專業人員，更多靠過往經驗保養維修，水平參差不齊，缺少專業儀器，對很多新車型束手無策，缺乏完善的管理制度，無法評估和監控車輛的完整性，有時只靠經驗判斷零件更換，且零件質量難保證。

在保修期內，不在 4S 店保養可能影響質保，雖國家規定不在 4S 店保養也可享受質保，但需把外面每次保養的內容、時間、公里數形成書面材料并汽修店蓋章。

所以，4S 店保養更有保障，普通汽修店價格有優勢但風險大。