上海汽車博物館進行展品保護主要有以下方式：

首先，設立了古董車修復工匠創新工作室。這個工作室配備了涵蓋車輛檢測到修復各環節的技術設備，能對古董車進行全方位細致分析和處理，還有設計科學、功能完備的專業操作臺，滿足復雜修復操作需求，為修復工作提供硬件保障。

其次，有專業的修復工匠團隊。像胡輝剛這樣的“上海工匠”，他們懷著修復文物的信念，努力做到修舊如舊，確保每輛車恢復當年出廠面貌。

再者，博物館接受社會捐贈。藏家捐贈藏品不僅能讓藏品得到更好修繕和保護，也能讓更多人感受藏品藝術價值。

此外，博物館精心維護古董車，使其能夠動態展示，為全球觀眾呈現獨特汽車文化體驗。

最后，博物館不斷推進自身建設，積極參與各種相關活動，致力于推動經典車保護與修復，比如積極響應上海市總工會的“上海工匠千人選樹計劃”等。

總之，通過這些舉措，上海汽車博物館有效地對展品進行了保護，為觀眾帶來了更好的參觀體驗。