汽車召回流程中保障車主權益主要有以下方式。

首先，制造商通過內部檢測、消費者投訴反饋或監管要求確定召回問題后，向監管機構提交召回計劃，并通過多種渠道通知車主，明確召回范圍、車輛型號和生產批次、原因及風險。

車主收到通知后，攜帶車輛行駛證等證件聯系當地授權經銷商預約維修服務。到達后，技術人員根據具體問題進行檢查和維修，可能包括更換零部件、軟件升級等，維修完成后，經銷商提供維修記錄和證明文件。

其次，在補償方面，車主可獲得免費維修或更換零件，如發動機、變速器、剎車系統等關鍵部件；可能獲得延長保修期，確保問題部件損壞時無需承擔費用；有時會有現金補償，彌補車輛召回產生的損失；還可能有免費檢查，確保問題及時解決；部分情況提供延長的道路援助服務。

另外，根據相關法律，經營者應對召回過程中車主支出的必要費用負責，如交通費用和誤工費。

若召回涉及質量問題導致人身傷害，受害者可要求支付醫療費、護理費、誤工費等，造成殘疾可要求支付生活輔助器具費、殘疾賠償金等，導致死亡需賠償喪葬費和死亡賠償金。質量缺陷導致財產損失，可要求恢復原狀或折價賠償及其他直接財產損失。

總之，車主應積極與廠商溝通，必要時尋求法律援助，維護自身權益。