汽車電腦故障診斷儀的操作難度不大。

操作時，先在車上找診斷座，通常在汽車駕駛室駕駛員左側上方的保險盒內或擋桿附近，按車輛型號來找準位置。然后根據診斷座型號選相應診斷接頭。再依據車輛銘牌信息，進入對應車型的診斷系統。接著按車輛需要診斷的模塊，像發動機、ABS、ECT、SRS 等系統去操作。讀取故障碼、清除故障碼、查看數據流和進行執行器測試等，依照診斷儀的提示操作按鍵即可。診斷儀一般都有使用手冊，照著說明容易上手。

汽車電腦故障診斷儀分專業和便攜式的。便攜式如萬車寶，體積小巧，通過藍牙連手機就能全車深度檢測，適合個人車主日常用。

使用時要注意一些事項。測試前要選對適配插頭，因為車型不同電源形式有別。檢測儀器額定電壓 12V，檢測時蓄電池電壓應在 11 - 14V 之間。要關閉車上用電設備，發動機節氣門得關閉，測試插頭和診斷座接觸要好。測試結束先切斷電源再拆數據線。

用診斷儀排除故障得認清故障范圍，比如自診斷系統監視的往往是電路，而非單個元件。還要區分時效故障，像元件失準是時效故障，元件損壞就是自生性故障。

操作方法大概是這樣：選擇適合的故障檢測接頭并連至解碼器連接線，將接頭連到汽車的故障診斷座上，車輛點火開關轉至 ON 位置，屏幕顯示菜單后按需要選擇子菜單，解碼器屏幕會顯示故障部位名稱，多個故障會同時顯示。清除故障碼與提取故障碼類似，選擇“清除故障碼”按提示操作。連接檢測電腦和汽車診斷接口，開機后選擇所測的車系、車款、系統，然后讀取故障碼，數據流，元件測試，匹配就行。